Basecamp Research 140 millió dollárt gyűjtött evolúciós adatokkal új antibiotikumokhoz

Philip Lorenz, a Basecamp technológiai igazgatója szerint a biológia sokkal nagyobb kihívást jelent az AI számára, mint a nyelv. A cég EDEN nevű biológiai AI modelljei a genommintákból tanulnak, hogy azokat orvosi célokra használhassák. A hatalmas adatgyűjtést célzott kísérletekkel párosítják, bár a kezelésekig még sok fejlesztőmunka várható. Eddigi eredményeik laboratóriumi és egérkísérletekből származnak, emberi biztonságosságuk és hatékonyságuk még nem bizonyított. (The Decoder)

Az adatbázis mérete és forrásai

A nyelvmodellek gyors fejlődésével szemben a biológiai AI terén a haladás lassabb, és a klinikai vizsgálatok felgyorsítása komolyabb feladat. Lorenz becslése szerint a Földön található nukleotidok száma 10^37, ami messze meghaladja az emberi nyelvben található mintegy 5 kvadrillió tokent. A nyilvános genomadatbázisok is hiányosak: az adatok 68%-a mindössze öt fajból származik, ebből 54% emberi. A Basecamp ezért helyi kutatópartnerekkel gyűjt mintákat a világ minden tájáról, hogy szélesebb körű adatbázist hozzon létre.

A cég a Microsoft Azure felhőjében képezte az EDEN első generációját, amely 9,7 trillió DNS-építőkövön tanult több mint egymillió új szekvenált fajból. Az adatbázis mérete várhatóan százszorosára nő a következő másfél évben, elérve az egy kvadrillió tokent. Ez a Trillion Gene Atlas projekt része, amelyben a Basecamp, az Anthropic, az Nvidia és mások is részt vesznek.

Evolúciós alapú gyógyszerfejlesztés

A Basecamp az evolúciót tekinti a gyógyszerfejlesztés kulcsának. A baktériumok közötti „biológiai hadviselés” során keletkező, riválisokat elpusztító molekulákból antibiotikumok válhatnak. A cég célja, hogy ne csak ismert vegyületeket fedezzenek fel újra, hanem új jelölteket tervezzenek a tanult mintázatok alapján. Ehhez rögzítik a genetikai anyag mellett a kémiai, fizikai és ökológiai körülményeket is, különös tekintettel a hosszú, összefüggő DNS-szakaszokra.

Az EDEN által tervezett antibiotikumok első állatkísérletei ígéretesnek bizonyultak. A Basecamp a sejtterápiák klinikai fejlesztésére összpontosít, amelyek célja a beteg sejtek génjeinek módosítása a szervezetben a rák leküzdésére.